El Programa de Ordenamiento Ecológico del Territorio Costero del Estado de Yucatán comprende un área total de 6,468.535 km2.

Para este ordenamiento la zona costera incluye la totalidad del territorio de los municipios de: Celestún, Dzilam de Bravo, Dzemul, Dzidzantún, Ixil, Progreso, RíoLagartos, San Felipe, Sinanché, Telchac Puerto, Yobaín; y la parte comprendida en la franja paralela al litoral de 20 Kms de ancho tierra adentro, de los municipios de: Baca, Chichxulub Pueblo, Dzilam González, Hunucmá, Mérida, Mococha, Motul, Panabá, Telchac Pueblo, Tetiz, Tizimín, y Ucu, según límites del marco geoestadistico de INEGI 2000.

Se introduce un área de contexto en la porción marina de la costa, con dos límites: una franja de 200m desde la línea de costa, donde se realizaron monitoreos y otra de 10km desde esta misma línea, donde se realizaron estudios socioeconómicos relativos a la pesca y el turismo. Esta zona no está sujeta a ordenamiento por este instrumento pero se considera de forma complementaria en el análisis.